More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04125 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 680 aa  903    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 690 aa  1431    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  61.01 
 
 		 682 aa  898    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 691 aa  862    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 705 aa  635    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 699 aa  773    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  60.25 
 
 		 557 aa  732    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 		 689 aa  959    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 693 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  63.07 
 
 		 702 aa  889    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  72.36 
 
 		 688 aa  1063    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  75.42 
 
 		 711 aa  1115    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 702 aa  635  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 703 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 702 aa  631  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 704 aa  621  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 700 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 702 aa  611  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 734 aa  530  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 592 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 592 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 663 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 577 aa  481  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 663 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 663 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 663 aa  479  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 672 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 553 aa  465  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 553 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 673 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 669 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 600 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 662 aa  449  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 690 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 664 aa  443  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 606 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 734 aa  433  1e-120  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 710 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 663 aa  433  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 574 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 684 aa  430  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 680 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 692 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 692 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 600 aa  425  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 599 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 597 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 605 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 605 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 595 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 614 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 544 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 544 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 595 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 597 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 611 aa  416  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1827  methionyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 572 aa  415  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 565 aa  413  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 544 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 544 aa  412  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 596 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 544 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  38.87 
 
 		 593 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 678 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 793 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 544 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 544 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 544 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 675 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 689 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 600 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 689 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 677 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 685 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 673 aa  405  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2197  methionyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 683 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 689 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 686 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2081  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 689 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0425  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 568 aa  401  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 678 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 600 aa  401  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 689 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 595 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 694 aa  398  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 688 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 679 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 676 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 676 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 680 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>