More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0170 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 680 aa  1412    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 		 682 aa  898    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 690 aa  903    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  61.4 
 
 		 557 aa  719    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 704 aa  650    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 702 aa  871    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 705 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 711 aa  914    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 693 aa  844    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  65.6 
 
 		 689 aa  957    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 691 aa  867    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 699 aa  749    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 		 688 aa  928    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 702 aa  634  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 702 aa  632  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 702 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 700 aa  626  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 703 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 734 aa  548  1e-154  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 592 aa  502  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 663 aa  500  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 592 aa  497  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 663 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 672 aa  479  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 663 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 663 aa  477  1e-133  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 553 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 600 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 606 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 605 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 669 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 734 aa  438  1e-121  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 574 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 673 aa  432  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  38.99 
 
 		 593 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 565 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 599 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 605 aa  426  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 540 aa  422  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 710 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 680 aa  422  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 663 aa  412  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 600 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 690 aa  414  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 595 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 664 aa  414  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 595 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 679 aa  412  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 793 aa  410  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 603 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 683 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 662 aa  412  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 614 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1827  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 675 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 694 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 595 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 597 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 680 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 600 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 600 aa  401  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 544 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 565 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 678 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 685 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 688 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 684 aa  399  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 676 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 544 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 714 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 676 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 717 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 550 aa  392  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 674 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 686 aa  391  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 677 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 544 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 544 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 617 aa  388  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 570 aa  389  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 731 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 599 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 544 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 683 aa  386  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>