More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1403 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 680 aa  652    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 691 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  71.9 
 
 		 704 aa  1071    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 699 aa  704    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 688 aa  647    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 690 aa  637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 711 aa  639    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  76.07 
 
 		 702 aa  1145    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 705 aa  1471    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  74.07 
 
 		 700 aa  1093    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  77.07 
 
 		 702 aa  1166    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 682 aa  669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  71.86 
 
 		 703 aa  1057    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  76.21 
 
 		 702 aa  1161    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 693 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 689 aa  611  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 702 aa  609  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  47.33 
 
 		 557 aa  513  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 734 aa  502  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 553 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 690 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 663 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 663 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 663 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 663 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 664 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 672 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 669 aa  435  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 565 aa  432  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 673 aa  430  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  37.97 
 
 		 593 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 592 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 662 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 599 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 710 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 592 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 606 aa  415  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 605 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 600 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  35.82 
 
 		 625 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 684 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 600 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 597 aa  399  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 617 aa  399  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 603 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 595 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 595 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 597 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 596 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 574 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 611 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 600 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 595 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 605 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 689 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 582 aa  379  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 689 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 614 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 689 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 793 aa  375  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 689 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  32.57 
 
 		 689 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 680 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 717 aa  375  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2197  methionyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 573 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 676 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1827  methionyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 572 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 679 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 676 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  32.67 
 
 		 677 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 698 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0425  methionyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00326727  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 678 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 677 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 677 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 734 aa  368  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 675 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 677 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 677 aa  365  1e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 677 aa  366  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 		 680 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 677 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 705 aa  366  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>