More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1197 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 680 aa  642    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 		 699 aa  702    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 682 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  73.62 
 
 		 702 aa  1093    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  74.07 
 
 		 705 aa  1102    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  69.53 
 
 		 703 aa  1020    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  77.52 
 
 		 702 aa  1140    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 688 aa  639    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 704 aa  1043    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 700 aa  1462    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  74.03 
 
 		 702 aa  1109    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 691 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 690 aa  625  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 711 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 693 aa  613  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 689 aa  611  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 702 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  46.18 
 
 		 557 aa  534  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 734 aa  494  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 663 aa  456  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 553 aa  452  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 577 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 664 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 672 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 690 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 663 aa  445  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 663 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 669 aa  442  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 600 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 662 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 663 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 663 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 565 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 710 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 592 aa  436  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 673 aa  432  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 605 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  36.87 
 
 		 593 aa  429  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 606 aa  423  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 599 aa  412  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 600 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 595 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 684 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 595 aa  405  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 617 aa  403  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 597 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 565 aa  403  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 570 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  36.52 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 600 aa  399  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 600 aa  398  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 596 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 574 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 570 aa  394  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 603 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 582 aa  392  1e-108  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 714 aa  391  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 595 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 605 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 717 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 676 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 689 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 673 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 676 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 680 aa  389  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  33.99 
 
 		 678 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 676 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 689 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 597 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 689 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 614 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 686 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 705 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 676 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 677 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 680 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 683 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 677 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 679 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 675 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 677 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 697 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 677 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 677 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  32.72 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>