More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1568 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 680 aa  749    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 691 aa  767    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 703 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 702 aa  694    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 704 aa  717    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 702 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 705 aa  698    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  50.28 
 
 		 693 aa  730    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 699 aa  1434    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  49.86 
 
 		 700 aa  686    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 690 aa  773    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 689 aa  727    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 682 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 688 aa  791    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 711 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 702 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 702 aa  724    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  51.23 
 
 		 557 aa  608  9.999999999999999e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 734 aa  545  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 577 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 663 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 663 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 663 aa  484  1e-135  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 663 aa  479  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 672 aa  475  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 592 aa  471  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 710 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 669 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 592 aa  465  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 673 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 600 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 690 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 664 aa  445  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 606 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 605 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 553 aa  439  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 684 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 679 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 597 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 673 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 679 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 683 aa  433  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 677 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 680 aa  429  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 677 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 677 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 677 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 677 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 675 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 677 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 677 aa  429  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 793 aa  428  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 677 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  35.94 
 
 		 677 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 680 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 734 aa  427  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 550 aa  425  1e-117  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 663 aa  425  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 595 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 685 aa  425  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 676 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 674 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 678 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 692 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 540 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 678 aa  420  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 599 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 688 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 717 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 605 aa  419  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 678 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 680 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 676 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 676 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 675 aa  419  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 595 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 698 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 678 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 614 aa  415  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 596 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 676 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 676 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 611 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 681 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 731 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 691 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 574 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 676 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2873  methionyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 677 aa  415  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 676 aa  415  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>