More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0543 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 673 aa  790    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 662 aa  837    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 705 aa  646    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 710 aa  1468    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 717 aa  660    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 690 aa  806    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  65.49 
 
 		 684 aa  978    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 664 aa  832    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 669 aa  874    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 663 aa  783    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 714 aa  630  1e-179  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 697 aa  621  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 708 aa  606  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 663 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 663 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 663 aa  513  1e-144  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 663 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 734 aa  486  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 672 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 699 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 690 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 688 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 680 aa  423  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 675 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 700 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 682 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 711 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  34.47 
 
 		 691 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 689 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 693 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 702 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 705 aa  412  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 683 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 698 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 678 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 679 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 680 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 676 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 675 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 676 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 702 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 689 aa  395  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 689 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 679 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 688 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 704 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 553 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 540 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 692 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 686 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 553 aa  389  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 673 aa  389  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 703 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 731 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 553 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 675 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 677 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 686 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  33.43 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 677 aa  382  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2839  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 713 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 677 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 677 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 685 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 677 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 680 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 691 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 677 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 696 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 674 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 711 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1678  methionyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 702 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 716 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 677 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1097  methionyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 679 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.915405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 726 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 670 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 670 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0856  methionyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 770 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 710 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 681 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 718 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>