More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2013 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  58.75 
 
 		 673 aa  868    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  66.42 
 
 		 663 aa  964    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 710 aa  831    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 		 662 aa  971    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 690 aa  921    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 684 aa  791    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 669 aa  828    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 664 aa  1377    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 705 aa  619  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 717 aa  619  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 714 aa  611  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 708 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 697 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 663 aa  547  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 663 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 663 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 663 aa  531  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 672 aa  499  1e-140  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 734 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 688 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 699 aa  445  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 690 aa  443  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 705 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 704 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 700 aa  436  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 702 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 702 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 693 aa  428  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 702 aa  424  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 682 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 691 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 689 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 711 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 680 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 702 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 679 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 680 aa  412  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 703 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 673 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 675 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 676 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 675 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 676 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 676 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 698 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 678 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 689 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 679 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 692 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 692 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 692 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 709 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 674 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 710 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 689 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 683 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 675 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 688 aa  389  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 540 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 553 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 690 aa  382  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 688 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 686 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 676 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 731 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 686 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 677 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 677 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 677 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 716 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 677 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 678 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 677 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 678 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  34.1 
 
 		 677 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 680 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 680 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 677 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 677 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 677 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 553 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 722 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 677 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 677 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 677 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 720 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 691 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 711 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 677 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 677 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 720 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>