More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2956 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 680 aa  867    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 699 aa  767    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  61.39 
 
 		 702 aa  873    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  59 
 
 		 711 aa  862    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 688 aa  865    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 702 aa  643    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 705 aa  647    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 		 693 aa  820    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 689 aa  908    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  73.19 
 
 		 682 aa  1055    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 690 aa  862    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 691 aa  1437    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  59.39 
 
 		 557 aa  704    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 702 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 702 aa  632  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 704 aa  623  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 700 aa  611  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 703 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 734 aa  497  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 592 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 663 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 663 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 663 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 663 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 672 aa  443  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 577 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 553 aa  435  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 553 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 553 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 673 aa  432  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 669 aa  432  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 662 aa  426  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 664 aa  422  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 600 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 690 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  35.72 
 
 		 663 aa  415  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 710 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 684 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 600 aa  401  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 540 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 574 aa  402  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 606 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 544 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 599 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 565 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 605 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 605 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 544 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 544 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 600 aa  391  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 595 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 544 aa  391  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 614 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 544 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 717 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  36.15 
 
 		 593 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 595 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 793 aa  389  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 595 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 544 aa  389  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 600 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 565 aa  386  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 544 aa  389  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 544 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 544 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 597 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 611 aa  383  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 680 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 734 aa  381  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 599 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 603 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 596 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 705 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 570 aa  373  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 582 aa  375  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 708 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 567 aa  369  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 674 aa  364  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 678 aa  362  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 678 aa  361  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2081  methionyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 572 aa  360  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 617 aa  360  6e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 565 aa  360  7e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 680 aa  359  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 718 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 718 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76328  methionyl tRNA synthetase  34.39 
 
 		 757 aa  358  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  33.55 
 
 		 625 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0425  methionyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00326727  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 697 aa  358  2.9999999999999997e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>