More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5716 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  70.4 
 
 		 605 aa  867    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  71.81 
 
 		 603 aa  903    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  69.18 
 
 		 599 aa  846    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  67.85 
 
 		 593 aa  865    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  71.48 
 
 		 600 aa  900    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  71.24 
 
 		 606 aa  879    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 		 596 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 		 600 aa  726    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  71.19 
 
 		 600 aa  917    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 597 aa  1238    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 617 aa  796    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  69.93 
 
 		 614 aa  905    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  69.92 
 
 		 597 aa  880    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  64.93 
 
 		 600 aa  822    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  69.35 
 
 		 605 aa  872    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 595 aa  805    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  71.4 
 
 		 595 aa  924    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  68.73 
 
 		 611 aa  856    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  70.33 
 
 		 595 aa  910    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  64.84 
 
 		 625 aa  817    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  69.44 
 
 		 599 aa  890    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 574 aa  617  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 592 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 592 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 565 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 553 aa  508  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 		 734 aa  508  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 553 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 553 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 699 aa  433  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 680 aa  427  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  41.43 
 
 		 557 aa  427  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 690 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 711 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 688 aa  422  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 540 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 544 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 544 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 544 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 700 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 704 aa  405  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 544 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 577 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 702 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 691 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 705 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 703 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 702 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 570 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 693 aa  361  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 568 aa  360  6e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 550 aa  356  5e-97  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 567 aa  353  5e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 582 aa  352  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 570 aa  351  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 565 aa  347  3e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01380  methionyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_1G09010)  33.84 
 
 		 658 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76328  methionyl tRNA synthetase  35.78 
 
 		 757 aa  336  5.999999999999999e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 663 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 		 672 aa  335  1e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 663 aa  335  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 663 aa  332  9e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2707  methionyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 		 572 aa  332  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 663 aa  331  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2197  methionyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2349  methionyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 572 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 734 aa  322  1.9999999999999998e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 793 aa  320  3.9999999999999996e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2045  methionyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 572 aa  320  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0425  methionyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 572 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2081  methionyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 572 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1747  methionyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 569 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3145  methionyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 570 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 673 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 710 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 557 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1827  methionyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 572 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 669 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 664 aa  302  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0963  methionyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 551 aa  296  8e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000994373 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2846  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 514 aa  296  9e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 662 aa  295  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2532  methionyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 514 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 663 aa  289  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 690 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 678 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 		 678 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 684 aa  280  8e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 673 aa  279  9e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>