More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2689 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 		 693 aa  852    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  65.6 
 
 		 680 aa  970    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  66.09 
 
 		 702 aa  934    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 		 711 aa  954    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 691 aa  926    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 		 688 aa  931    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 699 aa  741    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 689 aa  1430    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  66.12 
 
 		 557 aa  796    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 		 690 aa  976    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 682 aa  932    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 702 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 703 aa  626  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 		 705 aa  622  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 704 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 702 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 702 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 700 aa  611  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 734 aa  519  1e-146  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 663 aa  480  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 663 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 672 aa  474  1e-132  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 663 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 663 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 592 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 553 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 553 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 553 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 664 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 673 aa  434  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 606 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  40.3 
 
 		 593 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 710 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 684 aa  425  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 605 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 663 aa  420  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 600 aa  420  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 605 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 690 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 		 669 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 544 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 714 aa  412  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 544 aa  412  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 565 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 600 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 544 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 544 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 662 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 544 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 685 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 544 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 595 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 692 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 692 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 614 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 603 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 595 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 734 aa  400  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 544 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 544 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 570 aa  402  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 611 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 600 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 717 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 678 aa  399  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 595 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 570 aa  395  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 705 aa  392  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 688 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 678 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 680 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 600 aa  391  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 677 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1097  methionyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 679 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.915405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 709 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1126  methionyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 681 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 679 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 677 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 677 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 710 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 677 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 683 aa  389  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 677 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 675 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 567 aa  387  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 678 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 596 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1644  methionyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 679 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 692 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4315  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 679 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 673 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>