More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1936 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 673 aa  794    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 662 aa  837    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 717 aa  660    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 714 aa  650    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 705 aa  651    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 		 710 aa  996    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 690 aa  803    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 663 aa  800    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 684 aa  1419    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 		 664 aa  808    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 669 aa  861    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 708 aa  621  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 697 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 663 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 663 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 663 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 672 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 663 aa  492  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 734 aa  478  1e-133  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 688 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 699 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 690 aa  445  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 711 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 682 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 693 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 691 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 689 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 705 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 680 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 		 702 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 704 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 700 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 703 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 676 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 702 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 676 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 676 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 698 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 689 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 676 aa  391  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 689 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 673 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 689 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  33.52 
 
 		 689 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 675 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 683 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 692 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 678 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 675 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 680 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 679 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 680 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 686 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 688 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 679 aa  372  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 691 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 540 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 675 aa  364  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 678 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 678 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 731 aa  362  9e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 680 aa  360  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 716 aa  360  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 553 aa  359  8e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0856  methionyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 770 aa  359  8e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 696 aa  359  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 677 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  32.32 
 
 		 677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 677 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 677 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1211  methionyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 725 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 718 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 718 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 553 aa  357  5e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1052  methionyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 717 aa  357  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 711 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0709  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 725 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1057  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 725 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2304  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 717 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 720 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1617  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 717 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2982  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 717 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.326883  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5768  methionyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 720 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145693  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 686 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  31.74 
 
 		 720 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 		 676 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 726 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 		 710 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 678 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>