More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2993 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 708 aa  1435    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  63 
 
 		 714 aa  933    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  64.8 
 
 		 697 aa  951    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  63.37 
 
 		 717 aa  953    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 		 705 aa  967    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 684 aa  614  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 710 aa  612  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 662 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 690 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 664 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 669 aa  597  1e-169  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 673 aa  593  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 663 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 672 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 663 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 		 663 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 663 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 690 aa  402  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 688 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 734 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 711 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 682 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 689 aa  373  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 691 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 702 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 680 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 680 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 680 aa  365  1e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 702 aa  365  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 704 aa  366  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  32.06 
 
 		 705 aa  363  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 674 aa  360  7e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 692 aa  359  8e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 693 aa  359  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 700 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 675 aa  359  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 679 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 678 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 		 702 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 676 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 683 aa  355  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 676 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 678 aa  353  5.9999999999999994e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 		 683 aa  353  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 		 688 aa  353  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 673 aa  353  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 676 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 689 aa  352  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 679 aa  351  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 689 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 675 aa  351  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 		 686 aa  351  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 689 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 689 aa  350  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 676 aa  350  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 703 aa  349  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1678  methionyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 702 aa  349  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1753  methionyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 702 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 		 689 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 675 aa  347  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 698 aa  343  8e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  30.62 
 
 		 702 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 691 aa  339  9e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 		 686 aa  339  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 678 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 678 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 683 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 731 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 676 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  32.86 
 
 		 540 aa  334  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4315  methionyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 679 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1097  methionyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 679 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.915405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 678 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 677 aa  333  8e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1137  methionyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 		 710 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 678 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 		 681 aa  332  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  31.08 
 
 		 681 aa  331  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 680 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 676 aa  329  9e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2839  methionyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 713 aa  329  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 690 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2873  methionyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 677 aa  327  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 688 aa  327  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2926  methionyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 693 aa  326  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01790  methionyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 694 aa  326  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0911016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 677 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 677 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1126  methionyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 681 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 677 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 677 aa  326  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 677 aa  326  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 677 aa  325  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  30.71 
 
 		 677 aa  325  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 677 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2056  methionyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 689 aa  325  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.566745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>