More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1834 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 699 aa  791    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 		 680 aa  928    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  61.38 
 
 		 557 aa  738    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  60.66 
 
 		 702 aa  863    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  72.36 
 
 		 690 aa  1063    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 704 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 688 aa  1428    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 705 aa  640    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 702 aa  644    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 		 689 aa  917    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 693 aa  833    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  72.89 
 
 		 711 aa  1090    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 682 aa  886    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  59.54 
 
 		 691 aa  865    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 702 aa  631  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 700 aa  625  1e-178  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 703 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 702 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 734 aa  545  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 577 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 663 aa  480  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 673 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 663 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 663 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 592 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 663 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 672 aa  464  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 663 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 669 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 690 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 662 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 664 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 600 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 553 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 553 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 606 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 684 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 540 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 793 aa  432  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 574 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 710 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 605 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 734 aa  426  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 544 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 544 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 680 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 544 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 597 aa  422  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 683 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 544 aa  422  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 544 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 605 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 692 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  34.19 
 
 		 692 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 544 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 565 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 544 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  39.41 
 
 		 593 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 544 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 544 aa  416  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 674 aa  410  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 599 aa  412  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 673 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 		 614 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 679 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 600 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 679 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 		 692 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 690 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 595 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 570 aa  405  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 676 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 611 aa  405  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 675 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  34 
 
 		 680 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 676 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 565 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 681 aa  402  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 597 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 595 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 676 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 676 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 599 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 596 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 678 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 678 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 717 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 689 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 689 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 689 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  33.71 
 
 		 689 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 705 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 678 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>