More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1063 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 793 aa  1643    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 734 aa  713    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76328  methionyl tRNA synthetase  47.44 
 
 		 757 aa  560  1e-158  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01380  methionyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_1G09010)  46.26 
 
 		 658 aa  528  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04250  conserved hypothetical protein  45.63 
 
 		 724 aa  464  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.396797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 734 aa  439  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 688 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 699 aa  432  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 680 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 557 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 690 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0425  methionyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 572 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2081  methionyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 572 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2349  methionyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 572 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2197  methionyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1747  methionyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  33.43 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1827  methionyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 572 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2045  methionyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 572 aa  395  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2707  methionyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 711 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 577 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 693 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 705 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3145  methionyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 570 aa  378  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 565 aa  379  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 702 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 702 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 570 aa  376  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 704 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 700 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 689 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 702 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 570 aa  369  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 		 690 aa  365  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 		 703 aa  365  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 702 aa  363  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 565 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 582 aa  358  2.9999999999999997e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 592 aa  356  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 662 aa  356  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 669 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 544 aa  354  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 544 aa  354  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 663 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 565 aa  353  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 544 aa  352  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 592 aa  352  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  31.44 
 
 		 664 aa  351  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  34.49 
 
 		 557 aa  350  7e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 673 aa  350  8e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  35.82 
 
 		 600 aa  350  9e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 606 aa  349  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 663 aa  348  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 544 aa  347  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 544 aa  347  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 544 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  30.76 
 
 		 663 aa  345  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 663 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 663 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 544 aa  343  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 544 aa  343  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 568 aa  340  5.9999999999999996e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  31.2 
 
 		 710 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 605 aa  339  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 540 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 553 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 553 aa  334  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 573 aa  333  6e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 		 595 aa  333  9e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 553 aa  332  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 684 aa  332  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 717 aa  328  3e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 600 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 672 aa  324  5e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 595 aa  323  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 680 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 614 aa  321  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  33.28 
 
 		 603 aa  321  3e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 550 aa  320  5e-86  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 597 aa  320  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 689 aa  320  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 679 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 688 aa  318  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 692 aa  318  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 676 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 673 aa  317  6e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 676 aa  317  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 605 aa  317  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 676 aa  316  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 705 aa  316  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 675 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 689 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 599 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 675 aa  314  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  29.66 
 
 		 683 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>