More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0425 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0425  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 572 aa  1190    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3145  methionyl-tRNA synthetase  75.96 
 
 		 570 aa  913    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.433587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2349  methionyl-tRNA synthetase  93.71 
 
 		 572 aa  1130    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1747  methionyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 		 569 aa  726    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2197  methionyl-tRNA synthetase  79.37 
 
 		 573 aa  958    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2081  methionyl-tRNA synthetase  99.65 
 
 		 572 aa  1187    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1827  methionyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 572 aa  729    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2707  methionyl-tRNA synthetase  81.26 
 
 		 572 aa  987    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2045  methionyl-tRNA synthetase  78.98 
 
 		 572 aa  954    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 557 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76328  methionyl tRNA synthetase  38.09 
 
 		 757 aa  422  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01380  methionyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_1G09010)  38.86 
 
 		 658 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 793 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 690 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 699 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 734 aa  396  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 570 aa  395  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04250  conserved hypothetical protein  37.29 
 
 		 724 aa  390  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.396797  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 567 aa  391  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 565 aa  387  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 		 734 aa  387  1e-106  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 688 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  36.16 
 
 		 557 aa  381  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 682 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 680 aa  375  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 702 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 711 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 704 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 702 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 550 aa  369  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 700 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 705 aa  364  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 702 aa  364  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 582 aa  362  2e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 691 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 702 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 703 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 689 aa  353  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 592 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 553 aa  347  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 592 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 568 aa  347  4e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 553 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 600 aa  342  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 573 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 605 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 693 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 596 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 611 aa  324  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 606 aa  323  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 595 aa  320  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 600 aa  318  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 		 597 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 600 aa  312  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 605 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  35.3 
 
 		 600 aa  311  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 595 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 663 aa  307  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  34.02 
 
 		 593 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  32.96 
 
 		 595 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 599 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 		 673 aa  301  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  31.88 
 
 		 690 aa  300  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  30.83 
 
 		 625 aa  300  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 565 aa  299  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 663 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 662 aa  299  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 663 aa  299  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 540 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 597 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 		 663 aa  294  3e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 617 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 669 aa  286  8e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  32 
 
 		 664 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 663 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 710 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 599 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 544 aa  280  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1573  methionyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 675 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.960021  normal  0.561708 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 680 aa  278  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 672 aa  278  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  31.52 
 
 		 708 aa  277  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 717 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 676 aa  274  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 675 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2873  methionyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 677 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  32.33 
 
 		 677 aa  273  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 544 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2455  methionyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 675 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>