More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0083 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  56.82 
 
 		 693 aa  842    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  60.68 
 
 		 680 aa  894    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  62.62 
 
 		 711 aa  923    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 702 aa  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 702 aa  1462    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  61.39 
 
 		 691 aa  898    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 688 aa  884    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  63.07 
 
 		 690 aa  915    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  66.09 
 
 		 689 aa  940    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 699 aa  749    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  60.39 
 
 		 557 aa  717    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 682 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 702 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 705 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 702 aa  617  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 700 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 704 aa  600  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 703 aa  582  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 734 aa  503  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 663 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 592 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  35.89 
 
 		 672 aa  451  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 592 aa  449  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 600 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 663 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 663 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 663 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 664 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 553 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 577 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 553 aa  429  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 690 aa  420  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 595 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 606 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 710 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 662 aa  410  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 669 aa  412  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 595 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 673 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 605 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 605 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 614 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 611 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 684 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 663 aa  399  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 600 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  35.44 
 
 		 593 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 600 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 680 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 685 aa  390  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 565 aa  389  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 540 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 595 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 599 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 674 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0301  methionyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0520884  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 734 aa  382  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 717 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 603 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 544 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  33.76 
 
 		 675 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 683 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  32.19 
 
 		 793 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 694 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 596 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 582 aa  376  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 678 aa  379  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 679 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 570 aa  373  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 544 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 567 aa  375  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 544 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 688 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 544 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 680 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 714 aa  372  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 676 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 676 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 565 aa  369  1e-100  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 544 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2839  methionyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 713 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  32.09 
 
 		 676 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 544 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 692 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 678 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 690 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 683 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 557 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  34.43 
 
 		 625 aa  367  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 617 aa  367  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>