More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0820 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 663 aa  971    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 710 aa  832    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  68.27 
 
 		 690 aa  971    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 684 aa  821    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 673 aa  894    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 		 664 aa  971    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 669 aa  816    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 662 aa  1377    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 717 aa  625  1e-178  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 705 aa  613  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 708 aa  597  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 714 aa  591  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 663 aa  511  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 663 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 663 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 663 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 672 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 734 aa  465  9.999999999999999e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 688 aa  453  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 690 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 699 aa  445  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 682 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 702 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 691 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 700 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 702 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 705 aa  422  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 693 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 711 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 680 aa  412  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 704 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 703 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 689 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 540 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 702 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 679 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 698 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 675 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 		 675 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 		 679 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  34.01 
 
 		 731 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 676 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 689 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 689 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 676 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 676 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 678 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  32.8 
 
 		 689 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 689 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 689 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 553 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 673 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 683 aa  375  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  33 
 
 		 683 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 676 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 675 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 686 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 		 688 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 692 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 691 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 692 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 692 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 686 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2455  methionyl-tRNA synthetase  33.53 
 
 		 675 aa  364  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2554  methionyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 675 aa  364  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 565 aa  364  3e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3197  methionyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 		 675 aa  363  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000166166  decreased coverage  0.00110356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 678 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 		 678 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1314  methionyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 694 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 592 aa  362  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 676 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 710 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2873  methionyl-tRNA synthetase  33.14 
 
 		 677 aa  360  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 680 aa  360  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 709 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 680 aa  360  6e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  37.48 
 
 		 553 aa  359  8e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 696 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 681 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2546  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 694 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2982  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 717 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.326883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2304  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 717 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1052  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 717 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1057  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 725 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1617  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 717 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0709  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 725 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24373  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  32.61 
 
 		 690 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1211  methionyl-tRNA synthetase  32.44 
 
 		 725 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 677 aa  357  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 677 aa  357  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 677 aa  357  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02002  hypothetical protein  32.08 
 
 		 677 aa  357  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.701484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 677 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>