More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2846 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2846  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1043    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2532  methionyl-tRNA synthetase  95.91 
 
 		 514 aa  1006    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 540 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0067  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 544 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5183  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 544 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4862  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 544 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5147  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 544 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4903  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 544 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4747  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 544 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5278  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 544 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5192  methionyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 544 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5177  methionyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 734 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 553 aa  347  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 553 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  29.74 
 
 		 592 aa  323  4e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  31.77 
 
 		 592 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 688 aa  318  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 690 aa  314  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 711 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 		 689 aa  306  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  31.26 
 
 		 557 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 680 aa  303  7.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 693 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 682 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8622  tRNA synthetase class I (I, L, M and V)  30.41 
 
 		 593 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4070  methionyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 605 aa  296  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5716  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 597 aa  296  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0586  methionyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 605 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 699 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0979  methionyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 599 aa  294  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.625182  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  30.05 
 
 		 702 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 691 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0389  methionyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 606 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 577 aa  289  9e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  30.81 
 
 		 700 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0850  methionyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 595 aa  286  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13207  normal  0.94417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 565 aa  286  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0722  methionyl-tRNA synthetase  30.32 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000318448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0976  methionyl-tRNA synthetase  29.08 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000127359  normal  0.0415567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  31.22 
 
 		 710 aa  280  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 684 aa  281  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0780  methionyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 		 603 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 702 aa  280  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 702 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32490  methionyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 595 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2785  methionyl-tRNA synthetase  30.02 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0013223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 		 663 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 663 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03320  methionyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 600 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0902  methionyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 		 597 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320514  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 565 aa  274  3e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1042  methionyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 600 aa  274  3e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0685254  normal  0.461054 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  31.98 
 
 		 669 aa  274  3e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0346  methionyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 567 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1386  methionyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 		 595 aa  272  9e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.693312  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 		 570 aa  272  9e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 		 702 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 		 664 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4561  methionyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 611 aa  270  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 663 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  30.99 
 
 		 565 aa  270  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1317  methionyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 570 aa  270  5e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0492827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17560  methionyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 599 aa  269  8.999999999999999e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0814812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 673 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 703 aa  269  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0971  methionyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1256  methionine--tRNA ligase  30.65 
 
 		 625 aa  268  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  25.92 
 
 		 704 aa  266  8e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 663 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 705 aa  264  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1531  methionyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 617 aa  263  6e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0743167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  28.91 
 
 		 662 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 663 aa  260  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 		 717 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0136  methionyl-tRNA synthetase  28.62 
 
 		 582 aa  257  3e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 		 690 aa  257  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0642  methionyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 		 596 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.114108  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 573 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  31.72 
 
 		 568 aa  250  4e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 714 aa  250  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 705 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 654 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 734 aa  243  6e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2993  methionyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 		 708 aa  242  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.953372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 672 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  31.29 
 
 		 653 aa  237  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  28.13 
 
 		 680 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  28.47 
 
 		 793 aa  233  9e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1838  methionyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 557 aa  232  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.894587  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0963  methionyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 551 aa  232  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000994373 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01380  methionyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_1G09010)  27.04 
 
 		 658 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 697 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  30.98 
 
 		 632 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 		 679 aa  224  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 651 aa  223  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76328  methionyl tRNA synthetase  27.06 
 
 		 757 aa  222  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 680 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  27.38 
 
 		 678 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>