More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0307 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 
650 aa  832    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 
656 aa  731    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  67.54 
 
 
632 aa  898    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 
660 aa  776    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  62.57 
 
 
518 aa  687    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
665 aa  660    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
660 aa  769    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 
660 aa  770    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 
648 aa  832    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 
660 aa  769    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 
657 aa  731    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 
657 aa  731    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 
654 aa  908    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 
654 aa  689    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 
648 aa  726    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  60.87 
 
 
533 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  57.38 
 
 
660 aa  777    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 
647 aa  661    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 
659 aa  780    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
660 aa  769    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  62.8 
 
 
655 aa  827    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 
660 aa  770    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 
651 aa  848    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
650 aa  779    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 
664 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 
629 aa  676    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
653 aa  1343    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
634 aa  689    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 
660 aa  771    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  65.95 
 
 
512 aa  715    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  57.16 
 
 
660 aa  768    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
651 aa  636    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  51.53 
 
 
634 aa  648    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 
645 aa  823    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 
645 aa  822    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
650 aa  646    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 
660 aa  771    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 
675 aa  693    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
645 aa  785    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
666 aa  651    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 
681 aa  671    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 
702 aa  655    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
667 aa  640    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 
653 aa  783    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 
516 aa  692    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
645 aa  654    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 
629 aa  676    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
647 aa  755    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
638 aa  635  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
671 aa  619  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 
510 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
508 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
675 aa  612  9.999999999999999e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 
509 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
628 aa  611  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  55.8 
 
 
511 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 
509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 
509 aa  597  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
509 aa  594  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
642 aa  586  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
636 aa  585  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  54.3 
 
 
506 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
644 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
648 aa  568  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
642 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
624 aa  555  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
640 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
629 aa  551  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
638 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
632 aa  550  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 
663 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
657 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
636 aa  543  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
648 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
628 aa  535  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
642 aa  536  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
628 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
628 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
628 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
670 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
526 aa  506  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
539 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
519 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
515 aa  491  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
526 aa  490  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
530 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
538 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
516 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
529 aa  483  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
522 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
670 aa  483  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
511 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
515 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
515 aa  482  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  47 
 
 
722 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
515 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
550 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
530 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
516 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>