More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0963 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0963  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 551 aa  1145    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000994373 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0615  methionyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 565 aa  379  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 680 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2689  methionyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 689 aa  365  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 734 aa  364  2e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 699 aa  363  4e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 678 aa  363  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2630  methionyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 		 577 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 675 aa  362  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 679 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_331  methionyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 663 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 669 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 663 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 672 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 663 aa  356  5e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 688 aa  355  7.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 690 aa  355  8.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 663 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 680 aa  353  4e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 		 711 aa  353  5.9999999999999994e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0368  methionyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 553 aa  352  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000165751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0388  methionyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335428  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1626  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 573 aa  350  4e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1197  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 700 aa  349  7e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 680 aa  349  9e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1913  methionyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 568 aa  349  9e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.626919  normal  0.494976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 694 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 673 aa  346  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 686 aa  346  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 675 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 674 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 704 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 681 aa  343  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 678 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 702 aa  342  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 698 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 685 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 703 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 679 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 682 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0083  methionyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 702 aa  340  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 683 aa  339  7e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2056  methionyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 		 689 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.566745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 		 675 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 688 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 		 678 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 692 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 692 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 691 aa  336  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 683 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 689 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 676 aa  334  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1596  methionyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 700 aa  333  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0255918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 663 aa  333  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 676 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 682 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 710 aa  333  7.000000000000001e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 676 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1137  methionyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 710 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 689 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5898  methionyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 565 aa  331  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 689 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 681 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1126  methionyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 681 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1432  methionyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 700 aa  330  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.111821  normal  0.539533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19050  methionyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 678 aa  331  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.153863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2037  methionyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 592 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509449  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 689 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 676 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 678 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 678 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 692 aa  329  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 		 689 aa  329  7e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3011  methionyl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 592 aa  329  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.980202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1277  hypothetical protein  33.52 
 
 		 557 aa  329  9e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0125783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1097  methionyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 679 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.915405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 664 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4315  methionyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 679 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  33.51 
 
 		 702 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1644  methionyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 679 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 693 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 673 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1159  methionyl-tRNA synthetase  33.39 
 
 		 570 aa  327  5e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 691 aa  327  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4147  methionyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 682 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1287  methionyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 676 aa  326  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.742369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 696 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1779  methionyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 565 aa  325  1e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.368344  normal  0.651092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 705 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1709  methionyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 697 aa  324  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2839  methionyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 		 713 aa  324  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 690 aa  323  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 690 aa  323  6e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 		 717 aa  323  6e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05440  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 540 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.220303  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 670 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 670 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3044  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 676 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1573  methionyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 675 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.960021  normal  0.561708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>