163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1283 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  100 
 
 
111 aa  226  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  85.59 
 
 
109 aa  194  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  53.85 
 
 
110 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  57.29 
 
 
112 aa  100  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  53.85 
 
 
110 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  51.43 
 
 
112 aa  100  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  48.7 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  46.73 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  50 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  50.96 
 
 
109 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  45.83 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  46.43 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  50 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  50 
 
 
110 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  48.08 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  50 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  45.54 
 
 
117 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  47.37 
 
 
109 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  46.15 
 
 
115 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  47.12 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  49.47 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  47.12 
 
 
115 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  43 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  44.34 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  45.28 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  48.42 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  45.65 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  41 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  46.32 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  47.37 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  48.42 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  47.37 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  46.15 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  46.24 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  46.24 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  38.14 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  46.32 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  40 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  40 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  44.09 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  38.95 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  41 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  36.46 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  38.95 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  46.99 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  40 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  40 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  40 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  40 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  40 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  40 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  39 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  37 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  37 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  44.09 
 
 
111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  38.54 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  38.71 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  38.46 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  36.45 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 
672 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  36.46 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  38.54 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  36.47 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
628 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
669 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 
663 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
659 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
693 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
653 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
654 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
663 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 
660 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 
663 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
629 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
688 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
629 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  26.73 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
710 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  32.99 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
691 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.85 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  36 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
651 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
628 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  37 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  30.53 
 
 
653 aa  50.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 
634 aa  50.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>