More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3785 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  61.74 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  64.29 
 
 		 111 aa  147  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  51.3 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  56.64 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  55.45 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  60.71 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  58.88 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  58.04 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  59.82 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  52.25 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  51.82 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  49.55 
 
 		 112 aa  121  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  53.21 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  54.78 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  55.14 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  53.77 
 
 		 110 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  50.88 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  53.15 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  54.95 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  54.95 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  53.21 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  53.64 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  50.91 
 
 		 111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  51.89 
 
 		 109 aa  117  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  51.89 
 
 		 109 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  53.15 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  43.86 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  45.95 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  47.22 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  50.94 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  50.94 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  50.94 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  50.94 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  44.74 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  50 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  52.38 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  50.94 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  55.43 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  51.38 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  50 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  49.12 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  50.98 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  51.38 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  50 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  52.38 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  52.38 
 
 		 110 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  59.3 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  45.95 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  51.38 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  52.29 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  51.35 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  48.15 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  47.71 
 
 		 111 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  45.87 
 
 		 111 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  46.15 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  41.9 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 645 aa  73.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  38.71 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 634 aa  71.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 710 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 680 aa  68.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 640 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 688 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  39.47 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 692 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 670 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 675 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 698 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 682 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 678 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  29.57 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 680 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 689 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 676 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 650 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 676 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 654 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 683 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 636 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 676 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 689 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 679 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 689 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 689 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 676 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 686 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 689 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 690 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 673 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 672 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>