More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0847 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  100 
 
 		 117 aa  237  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  69.16 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  68.38 
 
 		 117 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  65.29 
 
 		 121 aa  160  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  68.52 
 
 		 110 aa  159  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  66.96 
 
 		 116 aa  157  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  70.37 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  68.7 
 
 		 145 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  67.83 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  67.83 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  69.52 
 
 		 115 aa  151  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  69.23 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  66.36 
 
 		 110 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  66.36 
 
 		 110 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  69.23 
 
 		 113 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  68.27 
 
 		 113 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  66.67 
 
 		 113 aa  148  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  66.67 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  65.38 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  65.45 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  63.64 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  66.98 
 
 		 110 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  65.14 
 
 		 111 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  62.39 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  64.55 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  62.62 
 
 		 123 aa  141  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  61.32 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  58.26 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  62.62 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  58.88 
 
 		 112 aa  130  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  58.88 
 
 		 112 aa  130  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  55.56 
 
 		 109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  56.07 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  55.56 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  54.63 
 
 		 109 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  54.63 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  54.63 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  54.63 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  53.21 
 
 		 109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  54.63 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  56.36 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  54.63 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  55.96 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  51.85 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  52.78 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  61.9 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  56.07 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  53.85 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  53.27 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  55.14 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  120  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  120  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 		 112 aa  117  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  53.21 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  50.47 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  51.92 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  47.37 
 
 		 116 aa  113  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  50 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  51.43 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  49.54 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  48.62 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  47.66 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  47.17 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  48.62 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  42.59 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  46.73 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  45.54 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 680 aa  80.5  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 693 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  48.54 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 710 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 670 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  42.34 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 672 aa  72  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 645 aa  70.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 653 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 654 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 642 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 698 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 682 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 628 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 690 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 674 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1132  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 696 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 711 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 676 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 653 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 663 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 686 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 662 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 676 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.5 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 657 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 680 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 648 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 676 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 692 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 688 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 676 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>