215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2343 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  100 
 
 		 109 aa  220  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  75.23 
 
 		 109 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  55.14 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  55.14 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  54.55 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  54.55 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  51.4 
 
 		 111 aa  117  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  51.4 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  51.82 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  51.82 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  49.53 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  53.27 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  54.72 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  55.34 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  50.47 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  51.43 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  50.96 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  49.53 
 
 		 123 aa  106  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  48.6 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  47.66 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  47.66 
 
 		 145 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  48.57 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  45.05 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  47.66 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  49.06 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  53.92 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  47.66 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  47.66 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  49.06 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  48.15 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  47.71 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  46.73 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  47.22 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  47.17 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  47.22 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  47.22 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  47.22 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  48.57 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  47.22 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  45.37 
 
 		 109 aa  99.4  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  44.34 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  44.86 
 
 		 123 aa  99.4  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  45.37 
 
 		 109 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  47.22 
 
 		 109 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  50.94 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  45.19 
 
 		 116 aa  97.4  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  48.11 
 
 		 113 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  46.3 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  47.06 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  41.9 
 
 		 111 aa  94.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  47.66 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  44.76 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  50.96 
 
 		 111 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  45.83 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  45.28 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  41.9 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  48.6 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  42.45 
 
 		 111 aa  90.1  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  43.4 
 
 		 112 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  41.51 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  42.72 
 
 		 121 aa  87  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  41.28 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  41.51 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  41.51 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  45.56 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  40.57 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  39.45 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  39.62 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 642 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 642 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 710 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 699 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  36.89 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 628 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 672 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 648 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 650 aa  60.1  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 645 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 669 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  34.91 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 640 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 647 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  29.63 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 670 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 682 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 690 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 734 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 657 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  34.91 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  34.91 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  34.91 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  34.91 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  34.91 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 693 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 711 aa  54.3  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  33.96 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  33.96 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  33.96 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 634 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 636 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>