More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2607 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  100 
 
 		 116 aa  231  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  65.05 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  64.22 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  64.66 
 
 		 113 aa  143  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  62.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  64.22 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  60.34 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  62.96 
 
 		 110 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  58.26 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  61.11 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  61.11 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  54.46 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  60.55 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  51.3 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  66.02 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  60.55 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  55.96 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  53.45 
 
 		 112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  57.41 
 
 		 109 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  57.63 
 
 		 145 aa  129  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  56.76 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  57.63 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  57.66 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  58.18 
 
 		 121 aa  127  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  57.14 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  55.24 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  58.33 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  56.76 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  53.15 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  55.93 
 
 		 123 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  55.36 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  55.86 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  55.14 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  57.69 
 
 		 110 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  53.04 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  57.14 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  54.46 
 
 		 113 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  53.21 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  51.82 
 
 		 111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  59.57 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  54.21 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  56.48 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  48.74 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  55.88 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  44.44 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  50.96 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  51.92 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  50 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  50 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  47.22 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  47.22 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  56.82 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  48.08 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  39.45 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  37.61 
 
 		 111 aa  95.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  41.35 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  41.18 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  45.45 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  46.32 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 686 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 680 aa  77.4  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 710 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 645 aa  77.4  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 690 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 685 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 680 aa  75.5  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 693 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 669 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 671 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 691 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 678 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 705 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 682 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 711 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 670 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 640 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 648 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2806  methionyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 688 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3483  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 688 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.854683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3834  methionyl-tRNA synthetase  33.05 
 
 		 706 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 690 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 634 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 		 678 aa  67.8  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 698 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 688 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 686 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 692 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 690 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 696 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>