111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3143 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  56.3 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  44.04 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  44.04 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  41.18 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  44.04 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  43.36 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  39.67 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  42.31 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  48.54 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  43.36 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  44.12 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  41.35 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  44 
 
 		 116 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  38.94 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  40.37 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  41.96 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  41.59 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  46.84 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  42.31 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  30.77 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  48.1 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  40.19 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  43.75 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  35.71 
 
 		 109 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  38.05 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  50.65 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  41.49 
 
 		 113 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  39.82 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  39.47 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  37.17 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  41.35 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  47.56 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  40.91 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  40.38 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  40.96 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  40.48 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  34.82 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  34.82 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  34.82 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  34.82 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  41.56 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  34.82 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  40.48 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  40.86 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  36.84 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  33.93 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  35.71 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  33.33 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  40.48 
 
 		 109 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  41.56 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  33.65 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  38.46 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  33.33 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  30.36 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  33.33 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  32.89 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  29.63 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  33.01 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  31.07 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  34.51 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  34.51 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  36.84 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  34.62 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 670 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 670 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  38.96 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 664 aa  50.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 693 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  30.43 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 680 aa  48.5  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 690 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 705 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 		 676 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 680 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 676 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 676 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 676 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 689 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 683 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  31.03 
 
 		 679 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  30.49 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 683 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02927  methionyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 661 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 678 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 678 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  29.21 
 
 		 691 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  29.76 
 
 		 686 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 674 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 689 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.36 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 689 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 689 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 681 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  30.23 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 710 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 		 686 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 		 711 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 689 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 		 675 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>