More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0655 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 114 aa  226  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 108 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  66.67 
 
 		 110 aa  150  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  62.96 
 
 		 113 aa  147  6e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  62.04 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 629 aa  119  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 		 629 aa  119  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  55.96 
 
 		 634 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1689  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  56.9 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  63.95 
 
 		 653 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 634 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 653 aa  108  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 650 aa  107  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 699 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 		 628 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 669 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 693 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 654 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 682 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 		 663 aa  100  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 672 aa  99.8  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 		 632 aa  98.6  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 671 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 664 aa  98.6  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 640 aa  98.6  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.56 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 688 aa  95.9  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 663 aa  96.7  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 711 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 663 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 663 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 680 aa  93.6  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 710 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 702 aa  92.8  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 702 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 673 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 648 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 692 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 692 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0597  tRNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 702 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 663 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.54 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 670 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 670 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 674 aa  90.5  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 722 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 704 aa  89.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5768  methionyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 720 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145693  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 705 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 651 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0856  methionyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 770 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 716 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 647 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 718 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 675 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 645 aa  89.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 720 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 720 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 718 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 711 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1617  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 717 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1057  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 725 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 662 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 688 aa  88.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2304  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 717 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0709  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 725 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2982  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 717 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.326883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 691 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 688 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1211  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 725 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 714 aa  88.6  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 710 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1052  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 717 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 678 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 663 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 726 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 645 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 717 aa  88.2  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 		 636 aa  88.2  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 690 aa  87.8  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 690 aa  87.8  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 657 aa  87.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 647 aa  87.4  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 683 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 680 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 642 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 710 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 636 aa  87  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 683 aa  86.7  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  43.81 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 709 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 650 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 678 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 678 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 660 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 679 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 645 aa  85.9  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 690 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 731 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>