More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1320 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  100 
 
 		 108 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  81.48 
 
 		 110 aa  191  4e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  79.63 
 
 		 108 aa  188  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  81.9 
 
 		 113 aa  185  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  62.04 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 		 629 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  59 
 
 		 634 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 		 629 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 		 672 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 653 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 634 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 654 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 699 aa  110  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 664 aa  107  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 628 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 663 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.56 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 650 aa  104  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 662 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 693 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1689  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.13 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 636 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 653 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 691 aa  100  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 682 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0597  tRNA-binding domain-containing protein  47 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 669 aa  98.6  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 651 aa  98.2  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 690 aa  98.2  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.54 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 647 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 640 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  51.16 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 673 aa  94.7  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 632 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 731 aa  94.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 659 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 656 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 663 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 671 aa  93.6  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 690 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 663 aa  92.8  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 702 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 663 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 663 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 663 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 675 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 642 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 704 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 636 aa  91.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 688 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 680 aa  91.3  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 645 aa  91.3  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 660 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 710 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 648 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 670 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 		 645 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 657 aa  90.1  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 657 aa  90.1  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 670 aa  90.1  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2758  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 689 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 702 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 645 aa  89.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 692 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 692 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 710 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 628 aa  88.6  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 679 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 711 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 670 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 726 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 678 aa  88.6  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 698 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 720 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 642 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 683 aa  88.2  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 675 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 720 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 702 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 628 aa  88.2  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 689 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 688 aa  87.8  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 678 aa  87.8  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 688 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 678 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 689 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0856  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 770 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 689 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0709  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 725 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24373  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 716 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>