More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1350 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 628 aa  1278    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 670 aa  737    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  78.04 
 
 		 642 aa  1043    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 640 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 636 aa  558  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 		 648 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 663 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 651 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 648 aa  529  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 642 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 657 aa  525  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 653 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 645 aa  509  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 632 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 650 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 648 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 647 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 629 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 629 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 670 aa  490  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 654 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 659 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 653 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 650 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 645 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 645 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 660 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 660 aa  482  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 660 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 660 aa  482  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 660 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 660 aa  482  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 660 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 628 aa  475  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 660 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 634 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 654 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 645 aa  462  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 647 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 655 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 638 aa  461  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 634 aa  458  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 664 aa  457  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 648 aa  457  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 650 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 656 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 657 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 657 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 624 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 651 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 671 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 510 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 665 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 675 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 702 aa  418  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 512 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3650  methionyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826271 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 667 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 638 aa  404  1e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 666 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 533 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 681 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 530 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 642 aa  396  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 518 aa  399  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 628 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 628 aa  392  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 675 aa  392  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 628 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 535 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 535 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 539 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 520 aa  382  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 493 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 530 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  36.32 
 
 		 629 aa  378  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 533 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 530 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 		 632 aa  373  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 531 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 644 aa  368  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 636 aa  366  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 538 aa  363  4e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0541  methionyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 546 aa  363  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 541 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 530 aa  362  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 530 aa  358  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  39.41 
 
 		 574 aa  357  2.9999999999999997e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>