More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0349 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 108 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  96.3 
 
 		 110 aa  207  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  80 
 
 		 113 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  79.63 
 
 		 108 aa  181  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  66.67 
 
 		 114 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 629 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 629 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  61 
 
 		 634 aa  120  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 634 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  53.21 
 
 		 672 aa  117  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  61.46 
 
 		 653 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 654 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 650 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 663 aa  110  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 664 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 669 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 		 699 aa  107  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1689  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.67 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 632 aa  106  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 663 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 663 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 653 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 663 aa  104  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 640 aa  104  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 662 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  60.61 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 651 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 693 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 636 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 647 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.9 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 		 663 aa  100  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0597  tRNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 690 aa  99.8  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 645 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 710 aa  97.1  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 645 aa  97.1  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 671 aa  96.7  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 645 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 673 aa  95.5  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 690 aa  95.9  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 682 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 691 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 659 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 688 aa  92.8  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  50.56 
 
 		 660 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 655 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 714 aa  92.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 702 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 731 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 704 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 636 aa  91.3  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 702 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 670 aa  90.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 628 aa  90.9  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 711 aa  90.1  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 702 aa  90.1  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 642 aa  90.5  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  50 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 660 aa  90.1  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 648 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 		 650 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 656 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 657 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 675 aa  88.6  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 647 aa  89.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 657 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 680 aa  88.2  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 663 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 705 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 638 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 670 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 642 aa  87.8  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 670 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 717 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 679 aa  87  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 651 aa  87  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 642 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 680 aa  87  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 710 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 645 aa  87  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 644 aa  87  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 648 aa  86.3  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 688 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 726 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 710 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 709 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 678 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1936  methionyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 728 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547314  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 692 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 692 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>