More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1512 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
647 aa  646    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 
632 aa  719    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
653 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  50.87 
 
 
655 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  54.59 
 
 
654 aa  725    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
651 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
648 aa  692    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
653 aa  736    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
650 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
650 aa  665    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
645 aa  674    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
645 aa  671    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  49 
 
 
645 aa  671    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
648 aa  1331    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
665 aa  632  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
660 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
659 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
660 aa  626  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
660 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
660 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
660 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
660 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
660 aa  625  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
660 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
660 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
660 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
657 aa  622  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
666 aa  622  1e-177  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
657 aa  622  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
656 aa  621  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
675 aa  621  1e-176  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
681 aa  619  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
645 aa  612  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
654 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
629 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
629 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
667 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
702 aa  601  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
664 aa  598  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
650 aa  592  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
647 aa  595  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
634 aa  593  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
651 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
634 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
512 aa  569  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
533 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
516 aa  561  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
675 aa  561  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
518 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
671 aa  535  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
663 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
638 aa  535  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
657 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
511 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
509 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 
508 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
628 aa  521  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 
506 aa  522  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
642 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
648 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
510 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
509 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
509 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
636 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
644 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
670 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
642 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
648 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
640 aa  485  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
632 aa  488  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
624 aa  486  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
638 aa  476  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
642 aa  472  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
636 aa  474  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
629 aa  474  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
628 aa  462  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
530 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
628 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
628 aa  452  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
628 aa  452  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
541 aa  444  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
526 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0724  methionyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
670 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
538 aa  445  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
526 aa  442  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
536 aa  437  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
511 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
539 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
546 aa  435  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
535 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
535 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
529 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
500 aa  431  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 
530 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
530 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
530 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
531 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
520 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>