More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0597 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0597  tRNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  276  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 628 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.49 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 710 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  48.48 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 634 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 650 aa  97.1  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 653 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 653 aa  95.1  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.47 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.45 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 669 aa  91.3  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.62 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 632 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 691 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 648 aa  88.6  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 664 aa  88.2  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.09 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1689  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.36 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 629 aa  87  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 629 aa  87  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3834  methionyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 706 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 671 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 651 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 654 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 710 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 672 aa  84  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 647 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 645 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 693 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1936  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 684 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0206169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 697 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 634 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0856  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 770 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 682 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 645 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 716 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 711 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 722 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 718 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 718 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 659 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 688 aa  80.9  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 726 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 720 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 720 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 731 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 688 aa  80.9  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 647 aa  80.9  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.18 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 651 aa  80.5  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3275  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 700 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 690 aa  80.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0695  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 663 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.708898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 709 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 710 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 666 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 663 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 628 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1617  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 717 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 688 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2982  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 717 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.326883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0709  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 725 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1052  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 717 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1211  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 725 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1057  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 725 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5768  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 720 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145693  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 642 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2304  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 717 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0924  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 689 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 655 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 648 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 714 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2806  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 688 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 675 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1843  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 717 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.108651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2546  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 694 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2642  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 694 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2449  methionyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 694 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0120068  normal  0.754199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1314  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 694 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 690 aa  77.8  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 645 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 628 aa  77.4  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 645 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 699 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 663 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 662 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0818  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 707 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3483  methionyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 688 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.854683 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 656 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 628 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 660 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 660 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 628 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 660 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 660 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1161  methionyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 697 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276181  normal  0.639478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 660 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 660 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 663 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>