More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0128 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 656 aa  1348    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 647 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 		 660 aa  910    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 665 aa  778    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 		 660 aa  906    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 		 660 aa  907    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  66.41 
 
 		 660 aa  907    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 655 aa  748    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 653 aa  731    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  64.95 
 
 		 648 aa  895    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  66.41 
 
 		 660 aa  906    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 		 660 aa  906    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 		 660 aa  907    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 650 aa  863    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 651 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 		 660 aa  910    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 		 632 aa  723    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 650 aa  763    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  89.19 
 
 		 657 aa  1226    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  66.46 
 
 		 659 aa  913    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 653 aa  697    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 654 aa  749    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 645 aa  677    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 645 aa  674    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 		 660 aa  907    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  89.19 
 
 		 657 aa  1226    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 		 660 aa  921    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 645 aa  699    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 666 aa  730    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 675 aa  697    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 681 aa  746    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 702 aa  757    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 		 667 aa  759    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 675 aa  772    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 518 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 664 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 648 aa  610  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 654 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 533 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 516 aa  591  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 645 aa  587  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 629 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 629 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 647 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 651 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 650 aa  574  1.0000000000000001e-162  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 638 aa  571  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 634 aa  566  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 508 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 671 aa  551  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 		 509 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 644 aa  542  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 509 aa  544  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 511 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 634 aa  538  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 629 aa  535  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 509 aa  529  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 506 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 638 aa  528  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 628 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 632 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 628 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 628 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 642 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 640 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 628 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 636 aa  503  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 624 aa  489  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 636 aa  492  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 657 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 648 aa  482  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 663 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 648 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 642 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 642 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 520 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 517 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 516 aa  458  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 670 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0187  methionyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 516 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 519 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 516 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 515 aa  452  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 527 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 628 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 523 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 544 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 538 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>