More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2030 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
671 aa  1383    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
653 aa  634  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
654 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 
653 aa  623  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 
648 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 
645 aa  614  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 
651 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
650 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
632 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
655 aa  596  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
660 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
645 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
629 aa  594  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
629 aa  593  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
660 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
645 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
660 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
660 aa  588  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
660 aa  588  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
660 aa  586  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
660 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
660 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
660 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
647 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
660 aa  580  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
650 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
634 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
656 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
634 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
657 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
657 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
675 aa  561  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
647 aa  558  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
645 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
648 aa  552  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
650 aa  552  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
628 aa  546  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
638 aa  547  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
665 aa  543  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
666 aa  543  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
663 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
640 aa  533  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
512 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
533 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
516 aa  528  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
657 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
642 aa  525  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
675 aa  524  1e-147  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
681 aa  524  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
667 aa  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  41 
 
 
654 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
642 aa  520  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
636 aa  519  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
664 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 
518 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 
509 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
702 aa  512  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 
511 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
670 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
509 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
506 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
651 aa  502  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
508 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 
509 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
510 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
648 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
644 aa  502  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
624 aa  497  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
509 aa  498  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
538 aa  497  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 
519 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
530 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
638 aa  487  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
632 aa  483  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
648 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
629 aa  478  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
546 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
539 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
511 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
511 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
636 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  47.24 
 
 
574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
515 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
541 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
722 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 
642 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
628 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
523 aa  462  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
628 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
512 aa  458  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
536 aa  456  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
525 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
516 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>