198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0786 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  100 
 
 		 119 aa  235  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  56.3 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  46.49 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  46.49 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  44.95 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  38.79 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  40.17 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  44.95 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  42.48 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  44.04 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  41.35 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  41.9 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  42.15 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  45.13 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  45.71 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  40.87 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  47.83 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  51.72 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  45.71 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  50.63 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  46.59 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  37.61 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  51.25 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  44.32 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  44.16 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  51.25 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  46.99 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  45.98 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  41.96 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  38.71 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  40.37 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  42.34 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  40 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  37.93 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  38.89 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  37.38 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  38.26 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  37.08 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  43.12 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  41.96 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  41.96 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  41.96 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  47.67 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  46.24 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  41.28 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  41.28 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  40.91 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  39.45 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  38.53 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  41.28 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  42.2 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  40.45 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  39.29 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  39 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  47.44 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  39.09 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 680 aa  65.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  44.87 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  37.96 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  44.44 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  35.4 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  35.4 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  33.96 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  36.89 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  42.68 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 648 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  41.67 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 692 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 698 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 664 aa  53.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 680 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 		 682 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  32.46 
 
 		 676 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 686 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 678 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 		 663 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 693 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 688 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 673 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 673 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 699 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 704 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 670 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.71 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 676 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 675 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 676 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  30.49 
 
 		 663 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 690 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 676 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 688 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  37.21 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  36.05 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 640 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 678 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 677 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 663 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 672 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>