158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2934 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  100 
 
 		 119 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  82.57 
 
 		 121 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  60.19 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  56.3 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  63.3 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  58.72 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  60.19 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  60.19 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  58.04 
 
 		 112 aa  134  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  57.8 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  60.55 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  54.24 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  58.33 
 
 		 113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 111 aa  130  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  61.11 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  58.33 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  60.19 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  62.96 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  55.96 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  59.8 
 
 		 110 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  56.6 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  57.27 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  51.85 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  55.26 
 
 		 123 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  52.78 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  52.78 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  56.48 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  56.48 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  53.7 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  54.39 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  54.63 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  53.33 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  49.55 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  44.74 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  48.62 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  47.71 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  50.46 
 
 		 111 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  53.7 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  53.7 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  48.57 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  50.91 
 
 		 111 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  51.38 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  48.15 
 
 		 109 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  51.85 
 
 		 128 aa  105  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  48.15 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  48.15 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  48.15 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  48.15 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  49.07 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  47.22 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  47.22 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  46.3 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  48.18 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  48.65 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  45.37 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  43.52 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  48.04 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  41.51 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  38.46 
 
 		 112 aa  84.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  42.42 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  38.95 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  44.44 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 648 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 682 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  30.91 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13510  EMAP domain-containing protein  31.67 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 		 691 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 		 642 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 657 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 663 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 693 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 659 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 655 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  31.82 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 640 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  38.96 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 690 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  28.83 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  26.61 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 660 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 660 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 660 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 660 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 		 660 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>