More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002668 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  100 
 
 		 110 aa  224  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  87.27 
 
 		 110 aa  201  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  200  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  200  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  85.45 
 
 		 110 aa  200  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  84.55 
 
 		 110 aa  200  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  84.55 
 
 		 110 aa  200  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  83.64 
 
 		 110 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  83.64 
 
 		 110 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  83.64 
 
 		 110 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03321  hypothetical protein  97.53 
 
 		 88 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  55.56 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 654 aa  89.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 664 aa  89.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 634 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 650 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 628 aa  87.8  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 642 aa  87  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01530  tRNA binding protein, putative  46.6 
 
 		 362 aa  85.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 653 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10666  predicted protein  41.18 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 654 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 672 aa  83.6  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 710 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 734 aa  83.2  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 657 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 651 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 648 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 642 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 663 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 693 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 663 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 663 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0820  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 662 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.816271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 659 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 682 aa  77.4  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 663 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 669 aa  77  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16545  predicted protein  39.6 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 688 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 793 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 647 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 647 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 680 aa  75.1  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 648 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 673 aa  75.5  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 663 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 690 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 711 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11830  predicted protein  39 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 660 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 689 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30537  predicted protein  40.98 
 
 		 221 aa  73.6  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 689 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 628 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  35.14 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 634 aa  72.4  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 676 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 689 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  36.52 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 676 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 645 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 653 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 632 aa  72  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  36.04 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 650 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 688 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 676 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 676 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 688 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 657 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 657 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 698 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 690 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 628 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 628 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 628 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 704 aa  70.1  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 645 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  42 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.22 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  39.09 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29913  predicted protein  40.21 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  33.33 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 679 aa  70.1  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 660 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 629 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 629 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.45 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_8479  predicted protein  32.04 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013168  normal  0.105392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>