278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10666 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10666  predicted protein  100 
 
 		 102 aa  211  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16545  predicted protein  69.61 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335884  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11830  predicted protein  60 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_8479  predicted protein  51.46 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013168  normal  0.105392 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13445  predicted protein  54.9 
 
 		 164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8112  predicted protein  65.48 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.371613  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29913  predicted protein  49 
 
 		 217 aa  106  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34527  predicted protein  42.42 
 
 		 161 aa  90.1  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.335485 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01530  tRNA binding protein, putative  44.23 
 
 		 362 aa  88.6  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  41.18 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  38.24 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  38.24 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  39.22 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  39.22 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  38.24 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  39.22 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  40.2 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  38.24 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  38.24 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65359  G4 quadruplex nucleic acid binding protein  46.08 
 
 		 381 aa  80.9  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 734 aa  73.9  0.0000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.62 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 654 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 691 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 676 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 642 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 650 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 676 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 676 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 676 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 663 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 689 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 634 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 628 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 675 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.25 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 689 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 689 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 689 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 689 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03321  hypothetical protein  42.47 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 678 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 663 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 629 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 629 aa  67.4  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  33.7 
 
 		 114 aa  67  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.59 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 793 aa  66.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 663 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 663 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 663 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1689  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.45 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 692 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 648 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 647 aa  66.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 675 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 654 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 659 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 731 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 682 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 680 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 		 664 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 688 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.78 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 645 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 688 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 679 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 678 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 660 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 699 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 648 aa  63.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10474  cofactor for methionyl-and glutamyl-tRNA synthetases, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15940)  33.33 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.134683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 710 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 693 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 680 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002981  methionyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 691 aa  62.8  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.869947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 673 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2758  methionyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 697 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30537  predicted protein  31.53 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02927  methionyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 661 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4147  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 682 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28697  predicted protein  38.14 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.869582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 655 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 673 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.29 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 683 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 657 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 657 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>