282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29913 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_29913  predicted protein  100 
 
 
217 aa  438  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34527  predicted protein  52.44 
 
 
161 aa  169  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.335485 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_16545  predicted protein  49.69 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335884  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11830  predicted protein  42.33 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13445  predicted protein  42.17 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01530  tRNA binding protein, putative  45.52 
 
 
362 aa  118  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10666  predicted protein  49 
 
 
102 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_8479  predicted protein  44.22 
 
 
148 aa  106  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013168  normal  0.105392 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65359  G4 quadruplex nucleic acid binding protein  38.96 
 
 
381 aa  105  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1063  methionyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
793 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8112  predicted protein  51.25 
 
 
88 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.371613  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8313  predicted protein  35.5 
 
 
164 aa  85.5  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105668  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30537  predicted protein  31.82 
 
 
221 aa  85.1  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
642 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10474  cofactor for methionyl-and glutamyl-tRNA synthetases, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15940)  31 
 
 
438 aa  82.4  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.134683  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
648 aa  81.6  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 
663 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  44.68 
 
 
110 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
654 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  44.68 
 
 
110 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  44.68 
 
 
110 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  44.68 
 
 
110 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  44.68 
 
 
110 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  43.62 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  43.62 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
628 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  43.62 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
710 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  41.28 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1314  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 
694 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
645 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
647 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2642  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
694 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0566418  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2546  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
694 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493596  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
699 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
670 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
634 aa  72.4  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
648 aa  71.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
693 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0094  methionyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
734 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.168493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
650 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.15 
 
 
110 aa  70.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
686 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28697  predicted protein  34.18 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.869582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  40.21 
 
 
110 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
657 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  46.91 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
663 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
663 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
647 aa  68.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
650 aa  69.3  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
636 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  43 
 
 
663 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
655 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.68 
 
 
113 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
663 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
691 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  33.1 
 
 
675 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
690 aa  65.1  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
640 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  39.78 
 
 
628 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
680 aa  65.1  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
636 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
688 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
660 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
660 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
660 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
660 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
660 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2601  methionyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
717 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
660 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
660 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
660 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2449  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
694 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0120068  normal  0.754199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
634 aa  63.2  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
645 aa  63.2  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
653 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 
711 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
651 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
683 aa  63.2  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1320  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.27 
 
 
108 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000452217  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
678 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
682 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03321  hypothetical protein  39.71 
 
 
88 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
638 aa  62  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  39.33 
 
 
114 aa  62  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
690 aa  61.6  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  34.55 
 
 
116 aa  61.6  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
660 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
642 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
689 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
653 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
731 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
714 aa  60.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0600  methionyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
734 aa  60.8  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.801197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
689 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.51 
 
 
114 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0808  methionyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
705 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0726  methionyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 
673 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.295956  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
689 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>