283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3419 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  65.77 
 
 		 111 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  67.59 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  63.64 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  62.73 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  64.22 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  60.71 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  61.11 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  63.64 
 
 		 113 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  65.49 
 
 		 113 aa  143  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  65.45 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  60.36 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  60.91 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  59.63 
 
 		 123 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  52.29 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  60.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  59.26 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 		 145 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 		 123 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  52.25 
 
 		 112 aa  130  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  58.33 
 
 		 113 aa  130  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  58.04 
 
 		 112 aa  130  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  56.52 
 
 		 116 aa  129  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  54.55 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  56.76 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  56.76 
 
 		 112 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  56.48 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  60.19 
 
 		 110 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  56.36 
 
 		 111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  59.46 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  53.15 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  58.56 
 
 		 110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  56.36 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  58.33 
 
 		 110 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  58.33 
 
 		 110 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  57.41 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  56.07 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  53.15 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  47.17 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  55.56 
 
 		 111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  50.91 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  55.05 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  54.63 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  49.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  49.53 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  53.4 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  52.73 
 
 		 111 aa  114  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  53.27 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  50.47 
 
 		 109 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  48.6 
 
 		 109 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  53.7 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  57.14 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  44.76 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  45.05 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 672 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  48.51 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  37.38 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 664 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 682 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  46.32 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 680 aa  68.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 		 654 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  33.33 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 693 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 663 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 640 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 663 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13510  EMAP domain-containing protein  35.78 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 691 aa  63.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 642 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 669 aa  63.5  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 663 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 670 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  32.43 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  32.43 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  32.43 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  32.43 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  32.43 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  32.43 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  31.53 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  31.53 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  31.53 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  38.68 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 638 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 653 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 663 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 648 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>