More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0969 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  100 
 
 		 112 aa  224  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  59.63 
 
 		 113 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  56.25 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  60.55 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  61.47 
 
 		 110 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 110 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  58.93 
 
 		 115 aa  133  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  58.56 
 
 		 123 aa  133  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  57.8 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  56.76 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  56.25 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  58.04 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  50.86 
 
 		 116 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  59.63 
 
 		 123 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  61.11 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  55.36 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  55.86 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  53.15 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  53.27 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  57.69 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  57.66 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  52.29 
 
 		 123 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  56.6 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  60.82 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  54.05 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  54.9 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  54.95 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  50.45 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  56.31 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  54.95 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  54.95 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  54.21 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  54.46 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  56.07 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  46.79 
 
 		 111 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  45.87 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  56.88 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  50.45 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  52.34 
 
 		 109 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  50.48 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  49.55 
 
 		 111 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  49.55 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  50.93 
 
 		 119 aa  109  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  49.55 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  48.65 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  45.95 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  49.07 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  50.47 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  52.78 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  48.65 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  50 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  51.43 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  43.24 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  43.52 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  44.9 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 672 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1347  methionyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 663 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.511485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  37.61 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 680 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 663 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 663 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1337  methionyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 663 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 640 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  38.94 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 670 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 648 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 678 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 690 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 645 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 		 710 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 691 aa  68.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 688 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 669 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 686 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 693 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 629 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 629 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 711 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.04 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 680 aa  67  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 702 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 692 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 654 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 682 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2013  methionyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 664 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 		 647 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>