233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0179 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  100 
 
 		 117 aa  236  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  65.18 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  65.18 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  70.65 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  57.27 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  56.36 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  55.96 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  55.45 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  52.99 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  54.46 
 
 		 111 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  53.15 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  54.63 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  51.35 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  56.86 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  51.79 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  55.56 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  53.7 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  52.73 
 
 		 111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  48.65 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  50.45 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  60.92 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  52.25 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 		 110 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  52.25 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  51.35 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  51.35 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  47.75 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  49.54 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  49.54 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  51.35 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  50 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  48.62 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  47.22 
 
 		 111 aa  103  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  49.54 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  49.54 
 
 		 110 aa  103  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  54.55 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  48.18 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  48.18 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  49.07 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  51.46 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  47.75 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  45.13 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  46.73 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  51.69 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  48.57 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  44.95 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  52.33 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  45.95 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  43.12 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  47.66 
 
 		 109 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  46.73 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  46.73 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  46.73 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  46.73 
 
 		 109 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  46.73 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  46.73 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  45.79 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  46.73 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  44.23 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  44.86 
 
 		 109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  42.34 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  42.45 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  43.24 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  40.57 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  36.27 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  41.67 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  33.33 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1156  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.19 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 686 aa  55.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 634 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 690 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 674 aa  53.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 680 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 675 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  32.99 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 689 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 689 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1776  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.65 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 689 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0349  tRNA-binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 689 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 689 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 		 678 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 653 aa  50.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  34.44 
 
 		 690 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 676 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 645 aa  50.4  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 711 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 629 aa  50.1  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1586  methionyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 733 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 629 aa  50.1  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 648 aa  50.1  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 688 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 634 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 722 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 710 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 692 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 654 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>