More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3167 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  85.71 
 
 		 113 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  83.93 
 
 		 113 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  82.57 
 
 		 113 aa  183  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  71.68 
 
 		 115 aa  177  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  70.64 
 
 		 115 aa  165  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  70.37 
 
 		 115 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  69.72 
 
 		 115 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  63.72 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  64.66 
 
 		 145 aa  153  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  64.66 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  62.07 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  63.79 
 
 		 123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  68.27 
 
 		 121 aa  149  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  67.27 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  62.07 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  65.77 
 
 		 113 aa  147  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  60.36 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  65.38 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  66.67 
 
 		 116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  64.22 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  65.45 
 
 		 111 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  67.59 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  60.19 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  68.81 
 
 		 110 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  68.81 
 
 		 110 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  60.18 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  61.82 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  59.26 
 
 		 111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  59.46 
 
 		 111 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  59.63 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  58.33 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  59.26 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  56.64 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  54.24 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  54.05 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  54.05 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  62.5 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  64.36 
 
 		 110 aa  130  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  55.05 
 
 		 111 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  54.55 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  53.15 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  60.55 
 
 		 111 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  54.55 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  53.64 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  53.04 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  58.62 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  57.66 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  56.07 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  52.53 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  55.14 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  54.21 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  52.34 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  52.34 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  52.34 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  52.34 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  51.4 
 
 		 116 aa  113  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  51.4 
 
 		 109 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  48.65 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  51.85 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  51.4 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  55.34 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  56.31 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  51.85 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  51.02 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 693 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  48.42 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 682 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 680 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  51.25 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 		 653 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 691 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 690 aa  71.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 648 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  46.84 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  33.93 
 
 		 664 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 711 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 660 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 659 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 654 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 705 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 640 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 672 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 688 aa  65.1  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 642 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 680 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 670 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 654 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 642 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>