230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2616 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  96.4 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  59.63 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  60.19 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  58.33 
 
 		 113 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 113 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  54.13 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  50.91 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  53.21 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  49.07 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  48.67 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  51.4 
 
 		 109 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  47.71 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  51.43 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  54.63 
 
 		 111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  44.55 
 
 		 113 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  47.62 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  48.62 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  45.87 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  48.62 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  47.71 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  49.07 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  49.07 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  51.85 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  51.85 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  50.93 
 
 		 112 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  46.3 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  48.15 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  49.07 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  49.07 
 
 		 110 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  51.92 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  48.15 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  47.22 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  48.18 
 
 		 111 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  47.17 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  44.44 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  46.79 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  46 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  46.3 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  47.22 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  44.55 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  39.09 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  46.73 
 
 		 109 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  45.87 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  45.79 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  44.86 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  44.95 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  45.79 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  45.79 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  45.79 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  45.37 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  45.79 
 
 		 109 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  44.86 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  41.28 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  37.61 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  43.93 
 
 		 109 aa  94  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  42.2 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  43.12 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  42.31 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  40.74 
 
 		 111 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  46.74 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  40 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  42.57 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  41.3 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  46.24 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 705 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 659 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 682 aa  60.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 702 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 642 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 660 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 645 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 653 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 702 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 657 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1113  methionyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 703 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 690 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 		 654 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 634 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1186  methionyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 702 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  29.36 
 
 		 670 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 664 aa  55.1  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 		 640 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  30.48 
 
 		 711 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 642 aa  54.3  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0655  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.35 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  33.96 
 
 		 663 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.17 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>