171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3229 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  100 
 
 		 109 aa  219  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  85.59 
 
 		 111 aa  194  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  54.9 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  54.9 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  54.9 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  53.92 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  55.88 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  50.98 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  50.98 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  53.47 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  49.02 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  48.04 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  49.02 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  49.53 
 
 		 110 aa  94  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  46.67 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  49.02 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  46.73 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  44.12 
 
 		 112 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  48.04 
 
 		 111 aa  88.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  52.04 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  47.06 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  47.12 
 
 		 123 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  52.04 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  48.04 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  46.53 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  48.08 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  51.02 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  48.51 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  49.5 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  46 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  46.08 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  45.45 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  42.57 
 
 		 111 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  42.57 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  47.52 
 
 		 111 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  42.11 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  48.51 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  45.54 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  42.42 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  45.54 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  40.2 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  40.2 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  37.25 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  41.75 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  43.3 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  41.75 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  43.88 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  42.86 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  42.86 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  42.86 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  42.86 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  42.86 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  41.84 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  47.06 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  40.82 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  37.76 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  38.14 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 672 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  41.94 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  39.77 
 
 		 111 aa  66.6  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  39.6 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 659 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  36.27 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 660 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  40.96 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  38.61 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  36.27 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 647 aa  57.4  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 628 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 653 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 669 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  43.59 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 636 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 693 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0543  methionyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 710 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1350  methionyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 628 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019937  normal  0.216507 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 653 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 651 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 654 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0625  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 663 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2825  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 690 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 648 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0003  t-RNA-binding domain protein  25.96 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.89 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1328  methionyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 663 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0597  tRNA-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 629 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 691 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.570356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>