227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0959 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  100 
 
 
112 aa  227  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  100 
 
 
112 aa  227  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  65.18 
 
 
117 aa  148  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  62.96 
 
 
119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  58.93 
 
 
112 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 
113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  61.22 
 
 
128 aa  137  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  54.05 
 
 
119 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  58.88 
 
 
117 aa  130  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  54.05 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  59.63 
 
 
115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  54.05 
 
 
113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  56.76 
 
 
111 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  56.52 
 
 
116 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  55.96 
 
 
117 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  55.36 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  58.72 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  56.25 
 
 
121 aa  124  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  55.05 
 
 
123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  52.25 
 
 
113 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  58.72 
 
 
123 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  56.76 
 
 
112 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  55.05 
 
 
111 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  50.47 
 
 
110 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 
121 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  54.95 
 
 
115 aa  120  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 
119 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 
110 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  54.13 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  52.68 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  54.13 
 
 
110 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  55.36 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  51.38 
 
 
111 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  53.15 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  56.88 
 
 
123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  51.79 
 
 
111 aa  116  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  53.21 
 
 
123 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  54.95 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  52.78 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  54.29 
 
 
110 aa  113  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  51.85 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  54.64 
 
 
111 aa  110  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  54.13 
 
 
116 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  53.27 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  53.27 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  53.27 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  53.27 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  53.27 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  53.27 
 
 
109 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  48.21 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  53.27 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  52.34 
 
 
109 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  52.34 
 
 
109 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  54.21 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  48.65 
 
 
111 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  52.34 
 
 
109 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  47.75 
 
 
111 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  47.22 
 
 
116 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  46.85 
 
 
111 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  42.86 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  48.45 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  46.23 
 
 
109 aa  92  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  41.51 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  40.2 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  37 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
648 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  31.19 
 
 
690 aa  63.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  33.03 
 
 
680 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
660 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
660 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
634 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  35.4 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
660 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
645 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
660 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
659 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
660 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
664 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
654 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
672 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
642 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  26.55 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  26.55 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
642 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  34.29 
 
 
669 aa  58.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  26.55 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
648 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  28.32 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  31.58 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  25.66 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  25.66 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  25.66 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>