213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07205 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  100 
 
 		 111 aa  230  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  69.09 
 
 		 111 aa  163  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  63.39 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  64.29 
 
 		 115 aa  147  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  62.73 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  59.63 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  56.36 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  55.96 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  62.39 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  53.15 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  56.76 
 
 		 111 aa  127  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  51.35 
 
 		 112 aa  126  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  54.13 
 
 		 111 aa  125  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  55.05 
 
 		 115 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  54.13 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  51.38 
 
 		 111 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  52.29 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  54.29 
 
 		 110 aa  123  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  51.82 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  54.63 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  49.55 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  54.63 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  58.62 
 
 		 119 aa  120  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  53.4 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  53.15 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  56.6 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  52.25 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  55.66 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  55.66 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  55.66 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  55.66 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  55.66 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  51.82 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  54.21 
 
 		 109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  48.6 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  53.27 
 
 		 109 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  49.09 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  62.35 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  49.55 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  59.77 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  54.72 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  54.72 
 
 		 109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  49.55 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  54.65 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  49.02 
 
 		 116 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  49.55 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  49.09 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  48.18 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  48.21 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  48.21 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  46.79 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  48.15 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  48.15 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  47.22 
 
 		 110 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  48.65 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  55.81 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  54.55 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  45.54 
 
 		 111 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  44.64 
 
 		 111 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  45.87 
 
 		 111 aa  98.6  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  44.95 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  41.96 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  45.05 
 
 		 109 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  39.62 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  40 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  39.77 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  38.54 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 670 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 680 aa  62  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  31.25 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  31.25 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  31.25 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  30.36 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  30.36 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  29.46 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  29.46 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  29.46 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 640 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  32.41 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1787  methionyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 678 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.00000218059  normal  0.016435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 686 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 648 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  28.57 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  30.36 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 686 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  31.48 
 
 		 675 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 		 645 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 692 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  31.07 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 669 aa  54.3  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 673 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 680 aa  54.3  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0103  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.18 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 654 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 670 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  32.04 
 
 		 650 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 690 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>