180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2196 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  100 
 
 		 111 aa  226  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  69.09 
 
 		 111 aa  163  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  59.63 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  61.11 
 
 		 123 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  57.41 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  59.26 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  54.13 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  52.29 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  59.43 
 
 		 110 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  56.48 
 
 		 115 aa  134  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  55.96 
 
 		 111 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  55.96 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  57.8 
 
 		 113 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  55.45 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  55.45 
 
 		 111 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  55.56 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  55.56 
 
 		 110 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  56.48 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  54.63 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  58.33 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  55.05 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  60 
 
 		 121 aa  127  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  55.05 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  54.72 
 
 		 123 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  53.21 
 
 		 112 aa  127  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  54.72 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  52.78 
 
 		 123 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  52.29 
 
 		 112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  54.72 
 
 		 123 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  56.6 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  56.6 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  56.6 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  57.55 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  56.6 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  56.6 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  55.45 
 
 		 116 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  55.66 
 
 		 109 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  50.44 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  56.48 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  55.14 
 
 		 109 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  53.85 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  57.01 
 
 		 109 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  53.64 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  56.48 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  53.21 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  53.21 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  51.38 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  51.38 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  50 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  50 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  50 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  50.48 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  47.32 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  46.79 
 
 		 111 aa  103  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  47.22 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  48.48 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  44.34 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  39.09 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  42.45 
 
 		 109 aa  90.1  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  45.63 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  40.37 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  38.14 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  39 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  38.46 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 648 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 680 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.43 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  28.97 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 669 aa  57.4  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 670 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  28.44 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 642 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 682 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4388  hypothetical protein  28.44 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.83427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3368  hypothetical protein  28.44 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 690 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0626  hypothetical protein  28.44 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 678 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 678 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 640 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02943  hypothetical protein  27.52 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0627  t-RNA-binding domain protein  27.52 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02893  hypothetical protein  27.52 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1011  methionyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 702 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.493296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3256  hypothetical protein  27.52 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3541  hypothetical protein  27.52 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 693 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 686 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  28.44 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 675 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 		 632 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  36.84 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 		 711 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2839  methionyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 713 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>