247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2738 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  100 
 
 
116 aa  235  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  61.17 
 
 
112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  54.46 
 
 
116 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  59.46 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  58.88 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 
110 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  62.39 
 
 
111 aa  127  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  55.45 
 
 
111 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  57.55 
 
 
109 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  57.55 
 
 
109 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  57.55 
 
 
109 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  57.55 
 
 
109 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  57.55 
 
 
109 aa  123  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  52.78 
 
 
110 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  56.6 
 
 
109 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  56.6 
 
 
109 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  56.6 
 
 
109 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  51.4 
 
 
111 aa  120  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  52.78 
 
 
123 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  56.07 
 
 
109 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  47.17 
 
 
111 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  54.21 
 
 
109 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  49.09 
 
 
116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  53.77 
 
 
112 aa  117  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  50.93 
 
 
145 aa  116  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  54.81 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  54.37 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  50.44 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 
123 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  49.54 
 
 
123 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  51.89 
 
 
123 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  50 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  51.4 
 
 
115 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  53.85 
 
 
115 aa  114  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  51.4 
 
 
119 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  47.37 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  53.85 
 
 
115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  50.47 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  51.38 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  50.94 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  51.38 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  50.46 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  48.62 
 
 
109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  46.79 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  50 
 
 
110 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  48.57 
 
 
119 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  50 
 
 
110 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  50.96 
 
 
111 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  49.52 
 
 
121 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  50 
 
 
110 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  47.12 
 
 
121 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  51.65 
 
 
128 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  46.3 
 
 
112 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  51.46 
 
 
117 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  50.47 
 
 
112 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  53.49 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  45.19 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  50.96 
 
 
112 aa  96.7  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  48.45 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  48.45 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  46.08 
 
 
109 aa  93.2  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  43.27 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  42.31 
 
 
111 aa  90.5  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  42.06 
 
 
111 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  40.57 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  38.79 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  41.18 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
682 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  30.77 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2956  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
691 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.570356 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
680 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
634 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
645 aa  63.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
648 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  36.27 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  33.02 
 
 
670 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
650 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  36.45 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 
654 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0447  methionyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 
714 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.381782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
653 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0888  methionyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
669 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 
690 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  29.09 
 
 
711 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
692 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
693 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1914  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1403  methionyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 
705 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.349899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
680 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
640 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
632 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1190  methionyl-tRNA synthetase  28.95 
 
 
702 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.975612  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1834  methionyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 
688 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.726687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2914  methionyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
697 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.743177  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  30.09 
 
 
665 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1367  methionyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
704 aa  54.7  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00459582  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
686 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
656 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
688 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  32.41 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>