239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3705 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3705  secretion chaperone CsaA  100 
 
 		 112 aa  233  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3017  export-related chaperone CsaA  62.16 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2197  export-related chaperone CsaA  64.81 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00780983  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_004310  BR1524  csaA protein  63.89 
 
 		 115 aa  150  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1835  export-related chaperone CsaA  63.96 
 
 		 123 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.504894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1642  export-related chaperone CsaA  63.89 
 
 		 115 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268123  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1556  export-related chaperone CsaA  63.96 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.688146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2147  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1685  export-related chaperone CsaA  63.06 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2754  export-related chaperone CsaA  60.36 
 
 		 113 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4223  export-related chaperone CsaA  63.39 
 
 		 111 aa  147  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1474  csaA protein  62.96 
 
 		 115 aa  147  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0503395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1324  export-related chaperone CsaA  65.74 
 
 		 110 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3167  secretion chaperone  60.36 
 
 		 119 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0847  export-related chaperone CsaA  66.67 
 
 		 117 aa  146  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0712399  normal  0.274277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2748  export-related chaperone CsaA  63.3 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2247  export-related chaperone CsaA  61.26 
 
 		 113 aa  143  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3327  secretion chaperone CsaA  60.36 
 
 		 112 aa  143  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.398704 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0624  secretion chaperone CsaA  59.13 
 
 		 116 aa  143  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.606293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2178  export-related chaperone CsaA  61.11 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2934  export-related chaperone CsaA  60.19 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.365556 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3365  protein secretion chaperonine  63.3 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3419  export-related chaperone CsaA  60.36 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.644369  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3010  export-related chaperone CsaA  63.3 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1224  secretion chaperone CsaA  58.72 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0737  export-related chaperone CsaA  58.18 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0959  secretion chaperone CsaA  58.93 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0163443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1103  secretion chaperone CsaA  58.93 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2644  putative export-related chaperone  59.46 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.857734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2196  export-related chaperone CsaA  57.41 
 
 		 111 aa  137  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.333494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3144  export-related chaperone CsaA  61.54 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.122466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3199  secretion chaperone CsaA  58.93 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3284  secretion chaperone CsaA  60.55 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1632  export-related chaperone CsaA  61.47 
 
 		 110 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.519844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5117  secretion chaperone CsaA protein  58.18 
 
 		 123 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.49485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6138  export-related chaperone CsaA  55.45 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2607  export-related chaperone CsaA  55.96 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337632  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3316  export-related chaperone CsaA  59.09 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0506  export-related chaperone CsaA  52.25 
 
 		 112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2468  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2616  hypothetical protein  49.07 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22570  CsaA protein  56.76 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00335584  hitchhiker  0.0000447955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07205  CsaA protein  49.55 
 
 		 111 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3785  methionine--tRNA ligase (methionine tRNA synthetase)  49.55 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.212802 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1379  export-related chaperone CsaA  54.13 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1905  CsaA protein  55.86 
 
 		 111 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3652  export-related chaperone CsaA  54.29 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0969  export-related chaperone CsaA  50.45 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1819  export-related chaperone CsaA  54.95 
 
 		 111 aa  116  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.106603  normal  0.690755 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0260  protein secretion chaperonin  54.21 
 
 		 109 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047809  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0179  secretion chaperone CsaA  51.79 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0941  export-related chaperone CsaA  57.84 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2135  chaperone CsaA  50.94 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.263106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2164  chaperone CsaA  50.94 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1917  chaperone CsaA  50 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0466699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1879  protein secretion chaperonin CsaA  50 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0973618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2064  chaperone CsaA  50 
 
 		 109 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1914  export-related chaperone CsaA  49.06 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2096  chaperone CsaA  49.06 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2054  chaperone CsaA  50 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1870  protein secretion chaperonin  49.06 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.544501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3253  chaperone CsaA  50 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00847037  normal  0.269365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2609  export-related chaperone CsaA  49.51 
 
 		 109 aa  103  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2738  export-related chaperone CsaA  46.3 
 
 		 116 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2343  export-related chaperone CsaA  44.34 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3951  export-related chaperone CsaA  41.12 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.384982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3229  t-RNA-binding domain protein  44.12 
 
 		 109 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1283  tRNA-binding domain protein  43 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7066  methionyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 693 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.842095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0170  methionyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 		 680 aa  63.9  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0619  methionyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 		 672 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002668  tRNA-binding protein YgjH  30.97 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 		 648 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0786  t-RNA-binding region  42.68 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779673  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1471  methionyl-tRNA synthetase  30 
 
 		 682 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 640 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 664 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1976  methionyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.7 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0857  methionyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 		 711 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.318688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1568  methionyl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 699 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 642 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 686 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 654 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 675 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 663 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 678 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 		 670 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1814  methionyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 642 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04125  methionyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 		 690 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0255166  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13510  EMAP domain-containing protein  35.14 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 681 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 636 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1003  hypothetical protein  28.32 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 678 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 647 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3143  t-RNA-binding domain protein  33.01 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00836239  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 671 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 688 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1053  methionyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 		 685 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.531844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 692 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>